成科轩 科技日报记者 盛利
在成都市疾病预防控制中心新冠肺炎疫情应急指挥中心，应急与业务管理办公室主任庹晓莉正紧盯“新冠肺炎密切接触者采集分析系统”，一刻不松懈地工作着。
作为成都都市科技局支持下，成都市疾控中心承担的“成都地区新型冠状病毒疫情应急响应模式的构建及应用”应急科技攻关项目中的重要组成部分，这套系统是庹晓莉和团队紧急科研攻关的成果，从研发到上线，仅仅用了72小时。
构建新型冠状病毒肺炎病例及密切接触者实时采集分析系统；掌握成都市新冠疫情的流行特征；探索成都市新冠病毒肺炎的时空分布规律……作为抗击新冠肺炎的“排头兵”该中心的科研人员，正与时间赛跑，在科研一线战“疫”。他们有的人已“连轴转”了1个多月，有的人每天工作超过16个小时，熬过数不清的夜……27日，科技日报记者走近这个用科技赋能战“疫”的特殊群体。
72小时诞生实时采集分析系统
干练、冷静，是庹晓莉给人的第一印象。在中心办公室里，她一直对着电脑，不断地记录着各种数据，作为成都市疾控中心应急与业务管理办公室主任，从2003年的SARS到2008年的“5.12”特大地震，从禽流感到甲型H1N1流感疫情，她一直都是在突发公共卫生事件中冲锋在前的“逆行战士”。
庹晓莉驻守的新型冠状肺炎疫情应急指挥中心，是疾控指挥调度及信息汇总分析的枢纽，成都市每日新冠肺炎疫情最新数据即来源于此。每天工作超过13个小时，有时候甚至通宵加班，电话24小时在线，这早已成为她的常态。
对密切接触者追踪管理，是疫情防控中的重要环节。如何精准的做到信息共享和统计分析，更是成了疫情决策的关键。“最开始我们采取的是人工统计报表的方式，随着新冠病人的数量增多，密切接触者的数量也越来越庞大，这给9个人的追踪统计工作组带来很大挑战。”庹晓莉说。
庹晓莉在工作中
在成都市科技局应急攻关项目的支持下，庹晓莉和团队在已有的疾病监测系统上，仅仅用了3天时间，就研发完成了“成都市新型冠状病毒肺炎病例及密切接触者实时采集分析系统”的1.0版，它将所有确诊病例、疑似病例以及密切接触者纳入一个完整的数据库，分级分类管理，快速追踪。
“时间就是生命，我们必须分秒必争。”庹晓莉说，研发期间团队成员每天都在紧张的防疫工作之余“见缝插针”商量、讨论，修改……目的就是让这个系统能够尽快上线。目前该系统管理的密接者累计已达到6000多人，密切接触者的信息追踪管理效率、数据采集汇总分析效能，均得到极大提升。
目前，庹晓莉与团队还在进一步完善系统功能。“一方面，系统采集信息的功能息需要完善。如复工人员的情况。另一方面，系统的统计分析的功能也需要不断完善。”庹晓莉说，团队计划聚焦数据的可视化呈现，把“枯燥”的数字代表的意义表达出来。“未来，其他的传染病防控，这套系统也将继续发挥重要作用。”
5小时出一张接触者“人物关系图”
“过去14天去了哪些地方？”“搭乘了哪些交通工具？接触了哪些人？”“吃饭的时候和谁坐在一起，和谁说了话？”新冠肺炎疫情暴发以来，岳勇所带领的成都市疾控中心流行病学调查组，正奔波在各处医院、隔离点。而这样的现场调查，短则2-3小时，多则甚至要3-5小时。
隔着密不透风的防护服，艰难的记录着每一次问答，他们只为找到“蛛丝马迹”，迅速确定所有密切接触者。
岳勇，是成都市疾控中心流行病学调查组副组长、传防科副科长。从1月15日，岳勇和他科室的12人，就全部进入了“备战”状态：白天，在疫情一线，询问确诊和疑似病例过去14天的活动轨迹和接触人员，展开流行病学调查；晚上，在办公室形成调查报告，分析可能的感染来源，初步预判高危风险的密切接触者，提出下一步工作开展方向。
在每日更新的“疫情地图”中有多少例确诊？有多少例疑似？又有多少密切接触者，他们都出现在哪里？在本次疾控中心承担的成都市应急科技攻关项目中，即提出要“掌握成都市新冠疫情的流行特征”、“通过典型的聚集性疫情案例，探索分析新型冠状病毒的传播模式”。
“从某种意义上来讲，流行病学调查与刑警办案一样，越快地排查锁定‘嫌疑人’就越有利于案件侦破或减少案件再发生。”岳勇说，团队会把疑似或确诊病例的行动轨迹、传染案例画成关系图，分析成都所有确诊病例传染路径、地区分布、人群特点；然后通过大数据，最终形成“流调”报告，提出合理的预防对策和健康服务措施。
岳勇和同事进行“流调”分析
“目前我们对新冠病毒的了解有限，还需要不断的加深认识。只有这些工作做得越深入，信息越细致，才能尽快掌握一手资料。”岳勇说。
用GIS系统探索病毒时空分布规律
在疾控中心微检科收样室，杜长慧在审读流调报告的间隙，正在抓紧时间构思测试GIS地理信息系统在疫情防控中如何发挥作用。在已掌握的数据基础上，如何形成对病毒规律进一步的系统认识？杜长慧团队和微生物检验科正在通力协作，正计划借助GIS地理信息系统，结合病原基因测序与进化分析，对病毒传播进行分子溯源，探索病例的传播模式及病毒进化的时空分布规律。
作为项目牵头人之一，杜长慧和团队已完成了大量的方法和技术测试和准备，数据整理和分析也在有序开展。他说，此前团队曾计划在成都地区诺如病毒的分子流行病学研究引入GIS系统，以研究病毒进化时空分布规律，已积累了一定的研究基础，此次也希望通过这项技术为新冠疫情防控提供帮助和支持。
杜长慧在工作中
“一边是整体，我们正在利用GIS系统，将探索成都市新冠病毒肺炎的时空分布规律，从群体角度构建其时空分析模式。一边是个体，我们通过前期数据搜集，从个案出发，构建个体传播轨迹展示技术。”杜长慧说。
与此同时，经过前期收集病例和密接的流行病学信息、采集病例的标本，科研团队还将建立基因测序方法，挑选合格标本进行测序与进化分析，整理并数字化流调信息，并在GIS系统和分子溯源技术的助推下，展示新冠病毒的传播模式及病毒进化的时空分布规律。
来源：科技日报 文中图片均由受访者提供
编辑：岳靓
审核：王小龙
终审：冷文生