多种新冠病毒突变在世界各地出现,世卫组织说要这么做!

▎药明康德内容团队编辑

近日,多种新冠病毒突变体的出现成为人们关注的焦点之一。在1月14日结束的世界卫生组织(WHO)第六次紧急委员会会议上,在世界各地出现的新冠病毒突变体是会议讨论的重要议题之一。在会后发布的新闻稿的首要位置,紧急委员会建议在全球范围内提高对新冠病毒进行基因组测序的能力,从而加强对新冠病毒突变体的监控。那么这些新冠病毒突变对抗击新冠疫情有什么影响?我们又应该如何应对?今日药明康德内容团队将结合公开资料,对这些问题进行探讨。

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受到关注的新冠病毒突变体

发生基因突变是病毒在自然演变中常见的现象,新冠病毒也不例外。最近多个新冠病毒突变体受到人们关注的原因是它们可能具有更强的传播性,或者可能具有逃避某些抗体免疫反应的能力。目前受到关注的新冠病毒突变体主要有三种,分别为B.1.1.7(最初在英国发现),B.1.351(又名为501Y-V2,最初在南非发现),和P1(最初在巴西发现)。B.1.1.7和B.1.351已经在世界上多个国家和地区被发现,而P1目前只在巴西和日本被发现。

▲世界范围内报告发现不同新冠病毒突变体的地区(黑色,社区传播;暗红色,输入案例;灰色,未发现;图片来源:参考资料[3],点击可见大图)

目前的初步研究显示,B.1.1.7和B.1.351均具有更强的传播性,P1突变体的传播性目前虽然没有得到确认,但是它携带着在B.1.1.7和B.1.351上发现的几个重要基因变异。

▲三种不同的新冠病毒突变体携带一些相同的基因变异(药明康德内容团队制图)

这三种新冠病毒突变体虽然看起来是在世界上三个不同地区独立出现的,但是它们携带着几个共同的基因变异。其中,名为N501Y和E484K的突变均发生在新冠病毒的刺突蛋白受体结合域(RBD)上。动物研究显示,N501Y突变可以增强刺突蛋白与其受体ACE2的结合能力,从而提高病毒的感染能力。而E484K突变被怀疑可能让新冠病毒逃避某些中和抗体的识别

近日在《细胞》子刊Cell Host & Microbe上发表的一篇研究中,研究人员对新冠病毒RBD出现哪些突变可能导致RBD无法被中和抗体识别进行了详尽的分析。研究结果显示,在RBD的E484位置出现的突变是导致RBD不被中和抗体识别的重要热点之一

▲可能导致新冠病毒刺突蛋白的RBD不被中和抗体识别的突变位点,字母越大说明突变导致RBD不被识别的能力越强,红框处为E484(图片来源:参考资料[10])

虽然目前没有证据表明,这些新冠病毒突变体导致COVID-19的症状更为严重,但是它们更高的传播能力也会新冠疫情的控制产生重大影响。在世界上很多国家和地区,医疗资源非常紧张,如果COVID-19患者数目加速增加,会导致更多患者无法接受合适的治疗,从而提高患者死亡率。

世界卫生组织建议加强对新冠病毒的基因组测序和监控

世界卫生组织(WHO)第六次紧急委员会会议结束后发布的新闻稿表示,紧急委员会建议加强对新冠病毒的基因组测序和对新冠病毒突变体的监控。虽然目前世界各地的研究人员已经在国际共享的数据库GISAID中存放了超过360000个新冠病毒的基因组数据,对新冠病毒基因组的测序工作也是研究人员能够发现这些突变体的原因,然而这些基因组大多来源于少数几个国家。例如英国和丹麦在GISAID中存放的新冠病毒基因组数目分别占总数的45%和7%。对于追踪病毒的演化和地域传播来说,这还不够。

为了帮助世界各国提高对新冠病毒的基因组测序和分析能力,世界卫生组织在1月8日专门发布了指南,对如何通过对新冠病毒进行基因组测序提高公共健康水平做出了指导。

▲构建一个成功的基因组测序项目需要的能力以及在不同能力情况下需要采取的行动(图片来源:参考资料[12])

指南指出,不同国家拥有的诊断能力,测序设备,以及对基因组数据的分析能力都不相同,因此应该根据自身的能力范围,设定切合实际的目标。通过基因组测序,可以达到的公共健康目标包括:发现和进一步表征新冠病毒并且协助开发应对手段;监控新冠病毒的传播和地域分布;监控新冠病毒的演变并协助开发应对手段

限制传播仍然是防止新冠病毒进一步演变的重要手段

不同新冠病毒突变体都携带相似的基因变异显示,在世界各地不同的新冠病毒在演化方向上有一定的一致性。而病毒的基因突变是在不断传播和增殖的过程中产生的,因此只要病毒不断传播和增殖,即使没有输入病例,造成新冠病毒传播力提高或者逃避中和抗体识别的基因变异仍然有可能产生。除了通过基因组测序监控病毒演变之外,接种新冠疫苗,提高对新冠病毒的免疫力,以及保持社交距离和良好个人卫生习惯,都能够帮助控制病毒的传播,从而降低它们进一步产生突变的机会。

注:本文旨在介绍医药健康研究,不是治疗方案推荐。如需获得治疗方案指导,请前往正规医院就诊。

参考资料:

[1] Alarming COVID variants show vital role of genomic surveillance. Retrieved January 15, 2021, from https://www.nature.com/articles/d41586-021-00065-4

[2] Tracking the international spread of SARS-CoV-2 lineages B.1.1.7 and B.1.351/501Y-V2. Retrieved January 15, 2021, from https://virological.org/t/tracking-the-international-spread-of-sars-cov-2-lineages-b-1-1-7-and-b-1-351-501y-v2/592

[3] New variant report. Retrieved January 15, 2021, from https://cov-lineages.org/global_report.html

[4] Dr Deepti Gurdasani. Retrieved January 15, 2021, from https://www.qmul.ac.uk/whri/people/academic-staff/items/gurdasanideepti.html

[5] How Dangerous Are New COVID-19 Strains? Retrieved January 15, 2021, from https://www.cfr.org/in-brief/how-dangerous-are-new-covid-19-strains

[6] Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings. Retrieved January 15, 2021, from https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586

[7] Estimates of severity and transmissibility of novel South Africa SARS-CoV-2 variant 501Y.V2. Retrieved January 15, 2021, from https://cmmid.github.io/topics/covid19/reports/sa-novel-variant/2021_01_11_Transmissibility_and_severity_of_501Y_V2_in_SA.pdf

[8] SARS-CoV-2 genomic sequencing for public health goals: Interim guidance, 8 January 2021. Retrieved. Retrieved January 15, 2021, from https://www.who.int/publications/i/item/WHO-2019-nCoV-genomic_sequencing-2021.1

[9] Statement on the sixth meeting of the International Health Regulations (2005) Emergency Committee regarding the coronavirus disease (COVID-19) pandemic. Retrieved January 15, 2021, from https://www.who.int/news/item/15-01-2021-statement-on-the-sixth-meeting-of-the-international-health-regulations-(2005)-emergency-committee-regarding-the-coronavirus-disease-(covid-19)-pandemic

[10] Greaney et al., (2021). Complete Mapping of Mutations to the SARS-CoV-2 Spike Receptor-Binding Domain that Escape Antibody Recognition. Cell Host & Microbe, https://doi.org/10.1016/j.chom.2020.11.007

[11] Genomic sequencing of SARS-CoV-2. Retrieved January 15, 2021, from https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/338480/9789240018440-eng.pdf?sequence=1&isAllowed=y

[12] SARS-CoV-2 genomic sequencing for public health Goals. Retrieved January 15, 2021, from https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/338483/WHO-2019-nCoV-genomic_sequencing-2021.1-eng.pdf?sequence=1&isAllowed=y

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