河南最好的大学，应该是两所：1、中国人民解放军战略支援部队信息工程大学
2、郑州大学
中国人民解放军战略支援部队信息工程大学：学校占地面积近8000亩，校区位于河南省郑州市高新技术开发区、洛阳市涧西区；
学校先后由原解放军信息工程学院、解放军测绘学院、解放军电子技术学院和解放军外国语学院合并组建而成。
学校隶属战略支援部队，主要为国防和军队现代化建设培养信息领域高层次人才，为军队2110工程重点建设院校、首批一流网络安全学院建设示范项目高校。
在军事院校中，它的综合实力仅次于国防大学、国防科大，稳居前三，而且其学科实力非常强劲。
只是因为军事院校的特殊性，以及它不参与地方高校评比，导致很多人会忽略它的存在。
郑州大学：211、双一流高校。河南省内地方高校的毫无争议的一哥，近些年在省内的大力支持下，发展非常迅猛。其2021年超过70亿的经费预算，也超过了很多985高校。
郑州大学规模也很大，学校总占地面积5700余亩，现有四个校区：主校区（郑州市科学大道100号）、南校区（郑州市大学北路75号）、北校区（郑州市文化路97号）和东校区（郑州市大学北路40号）。学校现有全日制普通本科生5万余人、各类在校研究生（含非全日制）2.2万余人，以及来自85个国家的留学生2500余人。其在校生总人数高居国内高校第一位！也是因为人数较多，所以，尽管学校已经得到了国内地方高校最多的经费预算，但如果一平均，按照生均经费来看，还是处于双一流高校的中下游。
学校设有哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学12大学科门类，
有临床医学、材料科学与工程、化学3个一流建设学科；有凝聚态物理、材料加工工程、中国古代史、有机化学、化学工艺、病理学与病理生理学6个国家重点（培育）学科；
化学、材料科学、临床医学、工程学、药理学与毒理学、生物学与生物化学、分子生物学与遗传学、神经科学与行为学8个学科（领域）ESI排名全球前1％。
如果说当初，郑州大学在评选“211工程”、世界一流大学B类时候，多少有些照顾成分在，但这些年，郑州大学在省内全力支持下，所取得的成绩和巨大的进步，个人认为，现在的郑州大学，已经完全配的上这个一流大学的称号了。
所以，河南最好的大学，军事院校当属中国人民解放军战略支援部队信息工程大学，地方高校应该是郑州大学，至于同样入选了双一流的河南大学，目前来说，和郑州大学相比，差距还是比较明显的。