只会简单检索?难怪你找不到文献!“文献检索”的四大招式,带你玩转新版PubMed

在之前的推文中,小编为大家介绍了多个常用的检索工具「中/英文医学数据库」戳链接。其中,最最最常见的英文数据库莫过于PubMed
不知道大家用PubMed多久了,是不是早已形成了一套属于自己的固定检索思路?什么,不要告诉小编,你还只会把关键词扔进搜索框检索而已?!那小编真的是“恨铁不成钢”了,为你浪费的那些时间感到不值!
2020年5月18日,美国国家医学图书馆(NLM)宣布新版PubMed正式替代旧版PubMed,成为当前默认设置的PubMed官方版本。目前我们所见的都是Pubmed新版检索界面,以下均以新版PubMed来演示怎么实现PubMed快速检索以及怎么追踪文献。
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01 PubMed检索规则
在介绍Pubmed检索文献方式之前,先让我们简单地了解一下“文献检索的含义以及PubMed的检索规则”。知道了基础的含义和规则后,自然会对学习PubMed检索大有帮助。
我们说的「文献检索」,通常是指狭义文献检索,指通过构建检索式(包括制定检索词、使用运算符、设置筛选项等),从文献储存系统中查找目标文献的过程。
PubMed的检索规则包括以下四点:布尔逻辑词、截词符、限定词、检索字段标识符。掌握规则之后,便可以进一步学习检索方式啦~
1.1 布尔逻辑词
指用于表达检索词与检索词之间的逻辑关系的运算符。常见的逻辑关系词有3个:AND、OR、NOT
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各逻辑词的意义注意事项:
检索运算符AND、NOT、OR必须大写;
默认检索词之间的"空格"为"AND"检索;
布尔运算是从左至右运行,可以通过括号来改变运算顺序。
1.2 截词符
截词检索是取检索词的一部分,加上截词符号一起进行检索。这种方式能解决检索词的单复数、词尾变化、同一词的拼法变异等问题。
PubMed支持截词检索,常用的截词符号为:
* 代表零或一个以上字母
?代表零或一个字母
截词检索只针对单个词,而对词组无效,如:bacter*, 可以检出以bacter为词干的单词bacteria、bacterium等最多600个单词。
截词符既可以放在检索词之前,也可以放在词语中间,或词语最后。
1.3 限定词
限定检索通过将检索词限定在一个或多个特定字段中,来减少搜索结果。
常用的限定检索符号为:双引号""。其表示强制检索,这个跟谷歌、百度等搜索引擎中的强制检索是一样的。
跟截词符不同,使用双引号进行强制检索可以应用于某个单词,也可以用于词组。
注意:所有的检索符号都必须是英文状态下输入。
1.4 检索字段标识符
可以在检索词后面加上字段标识符来指定检索词的含义,从而实现精确检索。
常用的检索字段标识符如下:
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AB摘要
AD第一作者的研究机构和通讯地址
ALL除音译提名及出版国家之外的所有字段
AU作者
CN合作者
DP文章出版日期
EDAT文章录入PUBMED的日期
1AU第一作者
FAU作者全称
GR资金资助号、合同号或由美国国家卫生研究院财政支持项目
LA文章出版语种
LASTAU最后一位作者,责任作者
MHNLM受控词汇
PL出版国家
PS人名作为文章的主题词
PT文章出版类型
RN酶号或化学物质登记号
SB子集
SI第二来源标示符
TA期刊全称、简称、ISSN.号
TI文章英文题目
TIAB题目/文摘
TT音译题目
TW自由文本次
VI期刊卷
PA药理作用主题词
02 PubMed检索方式
接下来就是重头戏了!在PubMed中,常用的文献检索的方式包括以下四种:基本检索、高级检索、主题词检索、作者检索
2.1 基本检索
基本检索是PubMed最常用的检索方式。在PubMed基本检索框中输入检索词,点击Search即可检索文献。比如,在检索框中直接输入Acute Kidney Injury prediction model,点击检索。
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在结果界面左边可以选择筛选条件来精确检索,比如说精炼文献类型、出版年份等等。
在进行基本检索时,可以在检索词后加上截词符号、字段标识符或布尔逻辑符等进行精确检索。比如,说检索具体某一篇文献,在文献标题后加[TI]可以限定检索文章标题。
PubMed主要可检索字段的标示名称有:
Limits (限定)
Publication Types:有7种类型
Languages:提供常用的7种语种
Ages:共有13个年龄段
Gender:男性、女性
Human or Animal
Subsets(子集):11个主要子集
Dates:可检索文献
2.2 高级检索
基本检索只适用于一般的检索,如果需要详细的更复杂的检索某一方面的文献,就需要高级检索了。
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通过搭配不同的字段标识符和布尔逻辑词,可以实现更精确的检索。
2.3 主题词检索
主题词检索也是PubMed常用的检索方式。主题词检索一般包括主题词副主题词两部分。
在进行主题词检索前,我们首先需要知道“什么是主题词?”“什么是副主题词?”以及“从哪里可以查询主题词?”。
主题词是将文献研究的主要论点概括成(标引)一个或多个规范化的语词。
副主题词是对主题词的某一特定方面的限定,具有专指性。在进行主题词检索时可以根据需要添加副主题词,可以添加多个,也可以不添加。
主题词在哪里查看?
在PubMed检索框右下角点击MeSH Database进入主题词数据库。
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输入检索词,点击搜索,即可进入主题词结果界面。
如下图所示,Acute Kidney Injury就是我们要找的主题词。
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点击Acute Kidney Injury后,进入主题词界面,在这个界面可以查看副主题词以及该主题词的其他信息。
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在下图,我们还可以查看该主题词的上下级主题词。
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如下图,我们选择Acute Kidney Injury作为主题词,选择epidemiology、etiology和mortality这三个词作为副主题词,使用OR逻辑词连接,主要检索AKI临床相关的文献。
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在生成的结果中,还可以使用筛选条件进行缩小范围。
2.4 作者检索
在进行作者检索时,需注意文献中作者名字显示方式和PubMed检索库中作者名字显示方式是不一样的。
文献中的名字显示方式:名在前,姓在后PubMed数据库中显示:姓在前,名在后
因此,在PubMed中进行作者检索时需考虑上述差异,构建检索式时应把姓放在前面。
我们在进行作者检索时,一般是检索导师或者某一领域的大牛,看看发表了多少篇论文等。在检索时需注意中国人姓名有些是三个字的,比如说张三丰(Sanfeng Zhang),在PubMed文献库中名字可能存在两种格式,Zhang sf OR Zhang s。检索时两种格式都要考虑检索。即:Zhang sf[au] OR Zhang s[au]。
另外可以考虑在进行作者检索时,添加作者机构检索词进行更精准的定位。但是考虑到院校重组合并以及跳槽等情况,所有在添加现机构检索词时需考虑以前机构的名称。
03 查全率和查准率
3.1 含义
在进行文献检索前,我们需要明白进行此次文献检索的目的,是希望查出来的文献更多些,还是希望查出来的文献更精准些。这就涉及到一个查全率和查准率的问题了。
查全率=查出来的相关文献/文献库中全部相关文献
查准率=查出来的相关文献/查出来的全部文献
查全率和查准率一般不可兼得,在文献检索中是需要查全率高些还是查准率高些看各自要求。
3.2 提高文献查全率
3.2.1 挖掘隐含检索词
就拿急性肾损伤而言,急性肾损伤在10多年前并不叫急性肾损伤,而叫急性肾衰竭、急性肾功能不全等,如果在文献检索中单纯只检索急性肾损伤,可能就检索不到急性肾衰竭和急性肾功能不全的文献。
再比如说预测模型,预测模型的叫法有很多种,预测模型、预测分数等,在检索预测模型文献时应考虑到不同的名称。以下都是预测模型相关的文献,叫法不一。
除了从文献中挖掘隐含检索词外,还可以从辅助工具如CNKI翻译助手、导师同学交流、主题词检索等方法中挖掘。
3.2.2 熟练使用各种检索规则
如上所示,文献中预测模型有很多名称,但是这些名称都有一个共同点:都有predict这个词。因此,可以考虑在检索的时候添加截词符号,如前面所说,可以使用predict*这个检索词。
在检索时也可以使用不同的字段标识符或布尔逻辑词OR来调整文献检索结果。还可以检索不同的数据库来获得更多的文献。
3.3 提高文献查准率
与提高查全率不同,查准率是要缩小文献检索结果,去掉不相关的文献。
提高文献查准率的方法也有很多,比如说使用字段标识符如[TI]、[AU]、[TW]等,或者使用限定检索词如双引号进行强制检索。另外也可以减少截词符号的使用。
如果是使用主题词进行检索,可以在主题词中添加1个或多个副主题词来缩小范围。
04 PubMed文献追踪
4.1 PubMed网站追踪
PubMed除了提供文献检索功能外,还提供文献追踪功能,比如说我们通过检索式Acute Kidney Injury[ti]检索文献,我们需要知道以后这方面的新文献,希望PubMed网站可以发信息通知我们。按如下步骤操作,需注册PubMed账号:
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来源:梅斯医学官网
编辑:三三亖
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