“小布”是哪种鲸?“舀一水”而识身份

连日来现身在深圳大鹏湾海域的布氏鲸,就着布氏鲸的学名,它们被昵称为“小布”(下文简称“小布”)。近日,由华大海洋党支部书记、华大海洋研究院常务副院长游欣欣博士带领的科研攻关小组,运用环境DNA(eDNA)技术和高通量测序技术,从水体样本中检测,“小布”与小布氏鲸样本的序列相似性最高,初步鉴定出“小布”是小布氏鲸。
图片
小布氏鲸是小的布氏鲸?华大海洋的科研攻关小组表示,根据从水体中捕获到的DNA片段,“小布”是跟布氏鲸不同的物种。
究竟是什么样的技能,可以“舀一水”而知“物种”?
据华大海洋研究院相关负责人介绍,eDNA是指在环境样品中所有被发现的不同生物的基因组DNA的混合,生物脱落的表皮细胞或粪便是eDNA的主要来源。
通过环境样品采集、过滤eDNA样品中的杂质,收集、浓缩和提取样品中的DNA,再通过PCR和/或高通量测序技术放大、解读这些DNA序列,理论上就可以知道环境中都有哪些物种了。 通常,eDNA技术主要用于检测陆生和水体环境中微生物(细菌、真菌),近些年开始在水生脊椎动物研究中崭露头角,例如无刺蝠鲼、鲨鱼等软骨鱼类和多种硬骨鱼类。
图片
“小布”在大鹏湾活动。 朱洪波 摄
“小布”与小布氏鲸样本的序列相似性最高
须鲸属是一类大型海洋哺乳动物,包含9个现生种,分别是4个曾被笼统划为布氏鲸的物种、普通小须鲸、南极小须鲸、长须鲸、黑板须鲸以及地球上有史以来最大的动物——蓝鲸。
那么,“小布”到底属于四种中的哪一种呢?
华大海洋科研人员通过对“小布”所生活的水域进行eDNA水体样品采集及高通量测序,以四种布氏鲸的线粒体全基因组序列为参考序列,从5.2×109条测序序列(52亿条测序reads),捕获到6条能比对到参考序列的序列, 这4条序列与已报道的保存在日本东京国立科学博物馆里的小布氏鲸样本的序列相似性分别为99%、100%、100%和100%,而与其他三个物种的序列相似性只有95% ~ 97%。
因此,可初步确定“小布”是一种小布氏鲸,特别和“小布”这个可爱的称呼相契合。
接下来,华大海洋会进一步对获得的eDNA数据进行分析,解读数据中鱼类的DNA信息,评估“小布”在大鹏湾活动海域的鱼类种类及其丰度,推测“小布”的饮食结构,为更好地“招待”这位“大朋友”提供参考借鉴,为大型鲸豚类的保护提供科学依据。
【撰文】郑婷婷
【通讯员】邝思燕
【作者】
【来源】 南方报业传媒集团南方+客户端