俞云松教授团队:厄他培南单药耐药CRE菌株的分子流行病学特征与治疗策略丨ESCMID Global 2024

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编者按:碳青霉烯耐药肠杆菌目细菌(CRE)已成为全球面临的重要公共卫生威胁。近年来,厄他培南单药耐药CRE逐渐成为领域内关注的热点话题之一。在第34届欧洲临床微生物学与感染病学大会(ESCMID Global 2024)中,来自浙江省人民医院俞云松教授团队的一项研究(摘要号:P1469)就报告了厄他培南单药耐药CRE的分子流行病学特征,研究发现产碳青霉烯酶的该类菌株在高浓度美罗培南环境下仍能生长,提示单药治疗可能失败。
厄他培南单药耐药碳青霉烯耐药肠杆菌目细菌的表型和基因型特征(摘要号:P1469)
背景
碳青霉烯耐药肠杆菌目细菌(CRE)是全球主要公共卫生威胁之一。近年来,有关厄他培南(ETP)单药耐药CRE菌株的报道越来越多,但最佳治疗方案仍不确定。本研究的主要目的是探讨ETP单药耐药CRE菌株的分子流行病学特征,进一步揭示其中产碳青霉烯酶CRE(CP-CRE)菌株的特点,以期为临床感染合理用药提供依据。
方法
根据菌种或菌种复合体类型,将ETP单药耐药菌株与同期分离到的美罗培南和/或亚胺培南(MEM/IPM)耐药菌株进行1:1随机匹配。通过抗菌药物敏感性试验、二代全基因组测序、改良碳青霉烯灭活法(mCIM)和逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)等揭示ETP单耐耐药菌株的特点。
结果
最终共收集到1 354株CRE菌株,其中18.8%的菌株对ETP单药耐药。ETP MIC分布曲线显示,ETP单药耐药组的MIC值较低,其中76%(193/254)的菌株MIC<16 mg/L(表1)。与MEM/IPM耐药菌株相比,ETP单药耐药菌株对β-内酰胺类、β-内酰胺酶抑制剂复方制剂、左氧氟沙星、磷霉素、阿米卡星和多黏菌素的敏感性增强(P<0.05,表1)。
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表1. 厄他培南单药耐药组与配对组的菌株特征及比较分析
系统发育分析结果显示,ETP单药耐药菌株具有较高的遗传多样性(图1)。
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图1. 两组菌株的系统发育树。(A)大肠埃希菌、(B)肺炎克雷伯菌复合体和(C)阴沟复合体
碳青霉烯酶基因的存在可能是两组间碳青霉烯耐药表型差异的关键因素(P<0.001,图2A)。
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图2. 两组碳青霉烯耐药相关基因
此外,与MEM/IPM耐药组相比,ETP单药耐药组中有限的CP-CRE菌株具有显著降低的超广谱β内酰胺酶(ESBLs)基因携带率、孔蛋白突变率和碳青霉烯酶基因表达水平(图3A-C)。值得注意的是,斑点试验结合半定量mCIM试验结果提示产碳青霉烯酶的ETP单药耐药分离株在美罗培南浓度比相应MIC值高8倍的环境下生长,同时伴有快速增强的碳青霉烯水解能力(图3D-E),提示美罗培南单药治疗过程中可能出现临床和/或微生物学失败。
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图3. 产碳青霉烯酶ETP单药耐药菌株的特点
结论
ETP单药耐药CRE菌株相对普遍存在,其具有与MEM/IPM耐药菌株不同的表型和基因型特征。临床治疗中应谨慎使用美罗培南单药治疗ETP单药耐药CRE感染,且应优先检测碳青霉烯酶。
▌参考文献
[1] Wang Y, Hu H, Shi Q, et al. Prevalence and characteristics of ertapenem-mono-resistant isolates among carbapenem-resistant Enterobacterales in China. Emerg Microbes Infect. 2024;13(1):2332658. doi:10.1080/22221751.2024.2332658
[2] Y. Wang, H. Hu, Q. Shi, et al. Phenotypic and genotypic characterization of ertapenem-mono-resistant carbapenem-resistant Enterobacterales. ESCMID Global 2024; Poster P1469.
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俞云松 教授
感染病学教授、主任医师
浙江省人民医院副院长
浙江大学求是特聘医师
浙江省卫健委领军人才
中国医药教育协会感染疾病专业委员会主任委员;
中华医学会细菌感染与耐药防治专业委员会副主任委员;
浙江医学会细菌感染和耐药防治专业委员会主任委员
国家卫健委抗菌药物合理应用和耐药评价专业委员会副主任委员
浙江省微生物技术与生物信息研究重点实验室主任;
中华预防医学会医院感染控制委员会常务委员;
中华医学会感染病学分会常务委员;
浙江省预防医学会医院感染控制专业委员会主任委员;
浙江省医学会感染病专业委员会副主任委员;
以第一作者和通讯作者发表SCI收录论文145篇;
先后主持国家自然科学基金7项(重点项目2项)。
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王银萍 博士
浙江大学医学院在读博士研究生
主要从事肠杆菌目细菌耐药与进化机制等相关研究,以第一作者发表SCI论文2篇。