编者按：随着全球抗微生物耐药性问题的加剧，新出现的耐药菌株对公共卫生构成了严重威胁。在第34届欧洲临床微生物学与感染病学大会（ESCMID Global 2024）中，来自北京大学第三医院沈宁教授团队的一项研究（摘要号：E0451）聚焦于国内尚未上市的头孢地尔的耐药性问题。该研究发现，头孢地尔能够在体外诱导耐药性和blaSHV-12基因扩增，长读长测序技术在本研究中展现了其在快速、准确检测抗性基因扩增方面的潜力，为未来的耐药性研究提供了新的工具。
全耐药ST11型肺炎克雷伯菌中blaSHV-12基因扩增导致的动态宿主内头孢地尔异质性耐药（摘要号：E0451）
目的
尽管头孢地尔（FDC）尚未在中国上市，但头孢地尔耐药的泛耐药高毒力肺炎克雷伯菌（PDR-hvKp）已经出现。本研究对临床Kp分离株进行FDC药敏实验，以探讨FDC耐药分离株的流行情况和FDC耐药机制。
方法
研究回顾性纳入了151株碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌（CRKP）分离株来评估FDC敏感性。从两名患者中纳入7株含blaSHV-12的分离株进行全基因组测序，测定了菌株的药物敏感性、毒力、blaSHV-12表达和适应性代价等表型，并通过qPCR和长读长测序进一步探究了blaSHV-12的扩增。
结果
测定的151株CRKP表现出较低的FDC耐药性（MIC50/MIC90=1/4 mg/L）。7株PDR-hvKP中共有两株菌表现为FDC耐药（MIC=32 mg/L）。两株FDC耐药分离株的IncR/IncFII质粒分别携带6或15个blaSHV-12拷贝，而其中4个FDC敏感分离株仅携带1个blaSHV-12拷贝，1株敏感分离株携带3个blaSHV-12拷贝。这些blaSHV-12基因位于IS26侧翼的同一个7.3 kb片段内，增加了blaSHV-12表达并造成FDC耐药，且不存在适应性代价。
图1. 从2例患者分离的携带blaSHV-12基因的IncR/IncFII质粒的序列比对
此外，研究发现FDC可以在体外诱导FDC耐药性和blaSHV-12的扩增，并在连续传代过程中逆转。
图2. 体外FDC选择压力下blaSHV-12扩增
结论
blaSHV-12的扩增及其导致的宿主内异质耐药是合理应用抗菌药物的重要问题。长读长测序可能是快速准确地检测抗性基因扩增的优选方法。
▌参考文献
Chao Liu, Juan Yi, Ming Lu, et al. Dynamic within-host cefiderocol heteroresistance caused by blaSHV-12 amplification in pandrug-resistant and hypervirulent Klebsiella pneumoniae sequence type 11. ESCMID Global 2024; ePoster E0451.
沈宁 教授
主任医师，教授，博士生导师
北京大学第三医院副院长
感染疾病中心主任
呼吸与危重症医学科副主任
中华医学会呼吸病学分会感染学组副组长
中国医师协会呼吸医师分会外事工作委员会副主任委员
中国女医师协会重症专业委员会副主任委员
中国女医师协会呼吸专业委员会常务委员
北京医学会呼吸内镜和介入学分会常务委员
中国医药教育协会感染疾病专业委员会委员
《The Clinical Respiratory Journal》副主编
《中华结核和呼吸杂志》编委等