最近有工作人员在进行重要文物“翠玉白菜”交接时，竟直接在文物旁边签收，距离之近，稍有不慎，便可能触碰到“翠玉白菜”，令其受损。事后，台北故宫博物院承认有疏失，并已惩戒相关人员，但仍引发岛内舆论声讨。据香港《大公报》报道，民进党当局自上台以来，无时无刻不在大搞“去中国化”，而台北故宫博物院内象征中华文明的文物，也被一些绿营人士视为“眼中钉”。近年来，有关台北故宫博物院文物受损、建筑“毁容”的新闻频频传出。
摔破文物
2022年10月，国民党民意代表举报台北故宫博物院文物受损，指控时任院长吴密察试图隐匿。吴密察随后召开记者会承认共有三件文物出现破损，分别是“明 弘治 娇黄绿彩双龙小碗”、“清 康熙 暗龙白里小黄瓷碗”以及“清 乾隆 青花花卉盘”。另外，吴密察11月初还证实，院内瓷器类文物历年有359件修复纪录，其中破损成碎片的文物至少250件。
包庇吸毒
2022年3月，台北故宫博物院驻点警员在值勤期间吸毒，但该驻点警员半年后才被院方免职，然而其前同事爆料，台北故宫博物院管理松散，该涉嫌吸毒的驻警已经是第二次被抓到，第一次疑似被压下来。
迟到缺勤
2022年，台北故宫博物院南院赖姓助理研究员曾多次使用远端连线打卡，实际上却迟到缺勤，院内人士指出当事人还曾有假日值班未到勤，以及擅用职务之便使用办公室，让闲杂人等随意进出，罔顾馆藏文物安全等违规情况。
贱卖图片
台北故宫博物院前院长吴密察在任职期间推动“数字典藏计划”，将馆藏文物扫描后，共40万张高清图用于内部研究，结果有人发现，有数千张高像素图档外泄，只需要花费10元人民币就能在网店上下载。台北故宫博物院于2023年3月证实，估算约有10万张高清图片外流。【来源：华夏经纬网】